Samo migotanie przedsionków nie jest chorobą śmiertelną. Jednak powikłania migotania przedsionków zwiększają ryzyko zgonu. Najgroźniejszym następstwem migotania przedsionków jest udar mózgu. Ponadto udowodniono, że ta arytmia zwiększa śmiertelność również u chorych po zawale serca oraz u chorych z niewydolnością serca. Odpowiednie leczenie, przede wszystkim leczenie rozrzedzające krew, znacznie zmniejsza ryzyko zgonu.