Gastroskopia w chorobie wieńcowej jest zazwyczaj badaniem bezpiecznym. Lekarz kwalifikujący do badania może ocenić obecność ewentualnych przeciwwskazań i zasięgnąć opinii kardiologa. Ponieważ często podczas badania pobiera się wycinki tkanki do badania histopatologicznego, należy pamiętać, że leki przeciwpłytkowe często zażywane przez chorych w chorobie wieńcowej (kwas acetylosalicylowy, klopidogrel, tikagrelor) mogą zwiększać ryzyko krwawienia w tej sytuacji. Zawsze należy poinformować lekarza kierującego na gastroskopię o zażywanych lekach i ew. skonsultować się z kardiologiem.